建议一：原址复建
民进南京市委一直关注大报恩寺遗址的规划建设，并在去年年初提交了一份提案：重新规划建设南京大报恩寺遗址公园，建议不必囿于大报恩寺遗址这个主题，而应依据长干里历代文化的渊源进行梳理、建设。如今一年过去了，大报恩寺园区建设也没有什么动静，为此，民进南京市委再次进言。
作为六朝古都的南京，与同为历史名城的西安、北京相比，缺一个综合规划的“大遗址保护区”来凸显自身特殊的历史文化地位。委员们认为，大报恩寺遗址的发掘正是一个好机会，建议借此开创南京第一个大遗址性的保护区。
既然是大遗址性保护区，当然就要着眼“大”字，不能光“纠结”于大报恩寺上了。委员们的初步设想是，这个区域内的考古勘探发掘部分全貌保留，这是园区的精华部分，也是主体，设立主题博物馆，展示东吴建初寺以来这个地区历史文化演进的全貌，其中建初寺、长干寺、大报恩寺等佛教文化可以做重点展示。整个遗址的范围要向四周适当扩大，“可北至中华门，南至雨花台，东至晨光路，西至雨花路。”
建议二：迁址重建
按照最初的规划，大报恩寺遗址上是要原汁原味复建一座大报恩寺琉璃塔，并以此为主题建一个遗址公园。南京市政协委员、玄奘寺住持传真也赞成恢复大报恩寺和寺塔，但他的建议是：迁址重建，推荐的新址是江宁的牛首山风景区。
传真说，现在的遗址范围非常狭小，可用于重建大报恩寺及寺塔的土地只有五亩左右，未来的大报恩寺是作为佛教圣地来迎接游客的，这么小的地方怎么适合呢？
“迁址从传统的风水上看，宜东不宜西，宜南不宜北，从大报恩寺原址中华门中轴线南延33里处正是牛首山，而且牛首山上有宏觉寺塔，相传明朝大报恩寺已把宏觉寺变为下院，自古传承。”综合这些因素考虑，传真力荐牛首山作为大报恩寺迁址的最佳选择。
